註冊表是啟動程序藏身之處最多的地方，主要有以下幾項：
1.Run鍵
Run鍵是病毒最青睞的自啟動之所，該鍵位置是[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run]和[HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run]，其下的所有程序在每次啟動登錄時都會按順序自動執行。
還有一個不被注意的Run鍵，位於註冊表[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer\Run]和[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer\Run]，也要仔細查看。
2.RunOnce鍵
RunOnce位於[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce]和[HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce]鍵，與Run不同的是，RunOnce下的程序僅會被自動執行一次。
3.RunServicesOnce鍵
RunServicesOnce鍵位於[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServicesOnce]和[HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServicesOnce]下，其中的程序會在系統加載時自動啟動執行一次
4.RunServices鍵
RunServices繼RunServicesOnce之後啟動的程序，位於註冊表[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServices]和[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServices]鍵。
5.RunOnceEx鍵
該鍵是Windows XP/2003特有的自啟動註冊表項，位於[HKEY_CURRENT_USER\\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnceEx]和[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnceEx]。
6.load鍵
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\WindowsNT\CurrentVersion\Windows]下的load鍵值的程序也可以自啟動。
7.Winlogon鍵
該鍵位於位於註冊表[HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Winlogon]和[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Winlogon]，注意下面的Notify、Userinit、Shell鍵值也會有自啟動的程序，而且其鍵值可以用逗號分隔，從而實現登錄的時候啟動多個程序。
8.其他註冊表位置
還有一些其他鍵值，經常會有一些程序在這裡自動運行，如：
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\System\Shell]
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\ShellServiceObjectDelayLoad]
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Policies\Microsoft\Windows\System\Scripts]
[HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Policies\Microsoft\Windows\System\Scripts]
小提示：
註冊表的[HKEY_LOCAL_MACHINE]和[HKEY_CURRENT_USER]鍵的區別：前者對所有用戶有效，後者只對當前用戶有效。
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